Семинария была учреждена указом Святейшего Синода в ноябре 1749 года, а в феврале 1750 года, при епископе Владимирском и Яропольском Платоне (Петрункевиче), в постройках упразднённого владимирского Успенского монастыря в Ветшаном городе начались занятия; первым ректором был архимандрит Павел (Томиловский)
Летом 1788 года семинария была объединена с Суздальской и Переяславской семинариями в одно учебное заведение, расположившееся в Суздале (во Владимире осталось лишь Владимирское духовное училище)
В 1798 году решением архиепископа Виктора (Онисимова) Владимирская духовная семинария была возвращена во Владимир. Находилась на Нижегородской улице у Сергиевской церкви. В 1804—1808 годах Н. Е. Федосеевым было построено каменное двухэтажное здание, в котором семинария располагалась до 1860—1863 годов, когда было построено новое трёхэтажное кирпичное здание.
В революционные дни 1905—1906 годов среди семинаристов происходили волнения: они приняли участие во всеобщей политической стачке в 1905 году, а в марте 1906 года устроили демонстрацию, протестуя против казни лейтенанта П. П. Шмидта. Для усмирения учащихся была вызвана полиция, пять человек арестовано.
В августе 1918 года семинария была закрыта, а здание реквизировано.
Недавно в антикварной лавке мне на глаза попался фотоальбом с выпуском какого-то дореволюционного учебного заведения. Никаких названий и подписей к фотографиям в нем нет, и лишь две фотографии на первом развороте указывают на учебное заведение, выпускники которого запечатлены на фотографиях. На одной из них вид города Владимира из-за Кляьмы, на другой здание владимирской губернской семинарии, :
Далее в альбоме располагались два коллективных фото
После этого шли фотографии преподавательского состава. Некоторых фотографий на своих местах не было.