Верхне-Донской округ решением Большого Круга Войска Донского планировалось создать ещё в конце 1917 года (первоначальное название предполагалось — Третий Донской округ).
В 1918 году из частей Усть-Медведицкого, Донецкого и Хопёрского округов был образован Верхне-Донской округ.
Первым атаманом Верхне-Донского округа стал Алфёров, Захар Акимович (1874—1957), казак станицы Еланской, генерал-майор (1918).