Родоначальницей полка была 38 АЭ, базировавшаяся на аэродроме Купля. Эскадрилья была основана в 1935 году. Весной 1937 года эскадрилья перебазировалась в Петергоф. На вооружении эскадрильи стояли самолеты И-5.
Осенью 1937 года командиром эскадрильи назначен летчик Романенко (впоследствии – Герой Советского Союза).
Зимой 1937-38 годов из 38 и 12 эскадрилий образован 42 Авиационный полк. Командир полка – Петрухин. Полк просуществовал одну зиму, и весной 1938 года эскадрилья вновь стала отдельной.
Незадолго до Финской войны эскадрилья переименована в 13 Отдельную АЭ, командир – Губанов. Место базирования АЭ – аэродром Купля.
В Финской войне эскадрилья выполняла задачи – штурмовые удары по островам: Бьерке, Сейскар, Лавенсаари, Пенисаари, Гогланд, Койвисто. Во взаимодействии с войсками нанесение ударов по кораблям противника, отражение самолетов противника, сопровождение бомбардировщиков и разведка.
Материальная часть в этот период состояла из самолетов И-15бис и И-16.
На одной из штурмовок был подбит и упал в воду у острова Сескар самолет летчика Николаенко. Летчик спасен.
21 апреля 1940 года эскадрилья награждена орденом «Боевого Красного Знамени».
Командиру АЭ Губанову и Комиссару Волосевичу присвоено звание Герой Советского Союза. Летчик Лукьянов награжден орденом «Ленина». Орден «Красного Знамени» получили летчики: Сизов, Чурбанов, Князев, Алехин, Погуляйко, Чабукиани, Николаенко, Новиков.
22 июня 1941 года 13 ОАЭ была поднята по тревоге с задачей прикрытия аэродрома Красная Горка.
К 30 июня эскадрилья имела 22 экипажа на самолетах И-16.
С 1 июля 1941 года новое задание – прикрывать мосты через реку Нарва. С 4 июля по 5 августа АЭ выполняла эту боевую задачу. Днем дежурили четыре звена из 12 И-16, командиры – старший лейтенант Сизов и лейтенант Алехин. Ночью – два звена первого отряда старшего лейтенанта Монахова, и звено Управления АЭ, всего 9 И-16.
За этот период летчики совершили 948 боевых вылетов, отразили 21 налет на мосты. При этом сбито: 6 Ю-88, 1 Хе-111, 1 Ме-109. Наши потери – младшие лейтенанты Панченко, Беликов и старшина Безмельницев.
5 августа 1941 года мосты через Нарву были взорваны.
3-й отряд 13 АЭ, летавший до войны на самолетах И-15бис, 3 июля был направлен в Воронеж, где изучил самолет Ил-2. К 11 июля на аэродром Купля прибыли 7 Ил-2. отряд сформирован в штурмовую эскадрилью ВВС КБФ (командир АЭ – капитан Барабанов, заместитель командира – капитан Карасев). 15 июля эскадрилья совершила первый боевой вылет.
12 августа 1941 года в воздушном бою сбито 3 Ил-2, летавших без прикрытия истребителей. Один упал в Усть-Луге, два – у аэродрома Купля. Немецкие истребители прекратили добивать «илы», только когда увидели взлетающие навстречу самолеты 13 АЭ. В результате погиб командир штурмовой эскадрильи, капитан Барабанов.
14 июля 1941 года противник прорвался к озеру Самро, и выдвинулся к станции Веймарн. В это время на станции Веймарн шла выгрузка войск и техники. От села Ивановское на север позиции занимали красноармейцы. От деревни Муравейно на север – немцы. У деревни Загорье – скопление войск противника.
На фронте Ивановское – Сабск – Хилок 13 КОАЭ получила приказ задержать продвижение противника, не допустив его к переправам на северный берег реки Луга, одновременно продолжая прикрытие мостов через реку Нарва.
Для выполнения приказа по задержке войск противника эскадрилья выделила 6 самолетов И-16 29 серии. Потери при штурмовке мехколонн составили: 7 самолетов, 1 летчик погиб, два получили тяжелые ранения.
За период с 19 июля по 27 августа эскадрилья прикрывала самолеты ДБ-3 и СБ, производившие удары по противнику в районе озеро Самро – Муравейно – Сабск.
После ухода 12 ОКАЭ на остров Эзель борьба с авиацией противника в направлении Нарва, Котлы, Копорье легла на 13 ОКАЭ. Одновременно АЭ выполняла задачу по прикрытию транспортов из Таллина в Кронштадт.
В середине августа в подчинение АЭ были переданы 6 И-15бис, которые сразу включились в штурмовку позиций противника.
И-15бис младшего лейтенанта Горюнова был подбит попаданием снаряда зенитной артиллерии в мотор. Летчик посадил самолет на шоссе Кингисепп - Веймарн.
25 августа погиб в воздушном бою командир отряда старший лейтенант Монахов.
28 августа АЭ перебазировалась с аэродрома Купля в Низино. В Низино работали всего девять дней. 7 сентября перелетели в Новую Ладогу. С этого дня по 18 марта 1942 года совершали боевые вылеты на охрану кораблей в Ладожском озере.
17 сентября 1941 года 13 АЭ получила задачу: 9 самолетами И-16 прикрыть 9 самолетов ДБ-3, которые тройками с интервалом в 45 минут будут наносить удары по противнику в районе Красногвардейск. Этот вылет можно считать самым неудачным в истории эскадрильи. Первое звено атаковано над целью, но благодаря защите истребителей, ушло без потерь. Остальные шесть самолетов ДБ-3 вылетели не на Красногвардейск, а на Лигово. По дороге первая тройка атакована Ме-109. И-16 вступили в бой и потеряли бомбардировщики из виду. Выйдя из боя, вернулись на аэродром. Таким образом, одно звено ДБ-3 осталось без прикрытия, и в районе Тосно атаковано 3 Ме-109. В результате, все три бомбардировщика сбиты.
18 марта 1942 года получен приказ – перебазироваться на аэродром Рузаевка в Мордовской АССР и пополнить эскадрилью самолетами ЛаГГ-3ф. С 18 марта по 15 ноября 13 АЭ находилась в тылу. При этом погибли двое летчиков – капитаны Алехин и Князев.
15 ноября 1942 года эскадрилья без матчасти перебазируется на аэродром Новинки Новгородской области, для формирования в полк. В часть приходит молодое пополнение.
21 ноября 1942 года – день рождения 13 ИАП.
Полк к 1 января 1943 года укомплектован личным составом на 80 %. К концу февраля учебные полеты закончены. Ранее летчики, имеющие опыт полетов на ЛаГГ-3ф, откомандировывались в распоряжение 3-го ГИАП ВВС КБФ, для участия в боях по прорыву блокады Ленинграда.
В апреле полк перебазируется на аэродром Борки. В мае начались боевые вылеты. В это время самолеты ФВ-190 часто бомбили и штурмовали аэродром.
7 апреля 1943 года командиром полка стал капитан Мироненко.
22 июля 1943 года полк принял участие в операции по расширению деблокады Ленинграда.
В сентябре основные задачи – сопровождение Ил-2 и разведка.
10 ноября 1943 года над Финским заливом летчик Бородин таранил самолет противника.
В операции по освобождению Ленинграда от блокады полк получил задачи: непрерывная разведка противника в районах Ропша, Красногвардейск, Кингисепп. Бомбоштурмовые удары по опорным пунктам Ропша – Гостилицы – Дятлицы, по эшелонам на ж.д. станциях Гатчина, Сиверская, Елизаветино, Волосово, Молосковицы, Кингисепп. Сопровождение и прикрытие Ил-2, прикрытие поля боя.
22 января летчику полка капитану К. Ковалеву присвоено звание Героя Советского Союза.
24 апреля 1944 года командиру полка полковнику Мироненко присвоено звание Героя Советского Союза, а 13 ИАП преобразован в 14 Гвардейский истребительный АП ВВС КБФ.
В феврале полк перебазируется на аэродром Котлы.
Летом 1944 года полк работал по прикрытию Ил-2 в море и на Карельском перешейке.
В августе полк участвовал в операции по освобождению Эстонии.
20 сентября 1944 года полк получил приказ перебазироваться на аэродром Паневежис Литовской ССР. 25 сентября перебазирование завершено.
20 сентября полк получил на вооружение самолеты Як-9м.
В середине ноября 1944 года за 14 ГИАП закрепили орден «Красное Знамя», который был получен 13 АЭ за финскую войну.
15 января 1945 года полк перебазируется на аэродром Грабштейн. Виду загруженности аэродрома, приходится в тот же день перебазироваться на аэродром Дресен. При этом погиб гвардии младший лейтенант Борисов.
Полку присвоено почетное наименование «Клайпедский».
9 мая 1945 года полк закончил участие в боевых действиях.
Основание: Фонд 160, опись 2с, дело 1 (Книга по истории полка).
Фонд 989 опись 0026321, дело 5 (Исходящие бумаги 13 ОАЭ за 1942 год).
КОМАНДИР
Лучихин А. Я., капитан. 26.6.–8.8.41
Денисов А. А., Герой Советского Союза (21.4.40), майор. 8.8.41–11.41
Сизов И. Ф., капитан. 29.3.42–13.1.43 (врид)
Шварев Г. М., майор. 1.43–31.5.43
Мироненко А. А., Герой Советского Союза (22.7. 44), капитан, майор, подполковник. 7.6.43–9.5.45
ЗАМЕСТИТЕЛЬ КОМАНДИРА ПО ПОЛИТИЧЕСКОЙ ЧАСТИ, ВОЕННЫЙ КОМИССАР (22.7.41–15.10.42)
Лукьянов И. П., старший лейтенант. 22.7.–26.8.41
Соколов С. А., батальонный комиссар. 11.41–3.10.44
Самохвалов П. Ф., майор. 3.10.44–9.5.45
НАЧАЛЬНИК ШТАБА
Ковширов Н. Е., майор. 22.6.41–6.41
Дмитриевский М. Е., майор. 7.41–20.1.43
Шаповалов М. Г., майор. 5.43–9.11.43
Антонов А. А., майор. 9.11.43–10.6.44
Шаров Д. М., Герой Советского Союза (5.11.44), капитан, майор. 10.6.44–18.1.45
Голосенко А. А., капитан. 18.1–9.5.45