Адрес: 308000, г. Белгород, Белгородский проспект, 75.
Основание в Белгороде духовной школы приходится на 20-е годы XVIII века. Белгородская Духовная семинария была создана в 1790 году иерархом Русской Православной Церкви Преосвященным Феоктистом (Мочульским), Архиепископом Белгородским и Обоянским. Данная семинария являлась духовным и общеобразовательным учебным заведением. В течение двух веков здесь изучались как богословские науки, так и светские.
Белгородская Духовная семинария является православным духовным образовательным учреждением Русской Православной Церкви. Семинария занимается образованием деятелей Русской Православной Церкви, готовит преподавателей, которые читают лекции не только в духовных но и в светских учебных заведениях, людей, которые работают в различных организациях Московского Патриархата, занимаются миссионерской деятельностью, служат священниками в вооруженных силах Российской Федерации.
Среди выпускников Белгородской Духовной семинарии особых выдающихся успехов достигли: историк Церкви митрополит Московский и Коломенский Макарий (Булгаков), 8 архиереев Русской Православной Церкви, профессор Московского государственного университета А. М. Иванцов-Платонов, доктор медицинских наук П. С. Платонов, который преподает в Санкт-Петербургском и Харьковском университетах.
Период советской власти был сложным для развития Белгородской Духовной семинарии. 17 июля 1996 года Священный Синод решил возродить деятельность духовной семинарии, которая получила статус «миссионерской». 28 сентября 1996 года произошло открытие семинарии, которая получила имя миссионера, апостола, Святителя Иннокентия, митрополита Московского и Коломенского.
В настоящее время Белгородская Православная Духовная семинария готовит православных миссионеров, обучая пастырей и мирян необходимым навыкам для их последующего миссионерского служения. Во время обучения воспитанники много ездят по разным уголкам России, благодаря чему у них накапливается личный опыт миссионерской службы.