Церковь во имя святой великомученицы Екатерины и святого равноапостольного великого князя Владимира построена в 1830 году вологодским губернским предводителем дворянства В. А. Волоцким как семейная усыпальница. Представляет собой небольшое здание в стиле ампир в виде ротонды с четырьмя неравными (боковые больше переднего и заднего) портиками.
Вблизи церкви находятся остатки монастырского некрополя, сильно повреждённого в советское время. В целости сохранилась лишь могила поэта К. Н. Батюшкова, скончавшегося в Вологде 7 июля 1855 года[12]. На кладбище монастыря были также захоронены митрополит Сарский и Подонский Иона, архиепископ Вологодский и Белозерский Симон, статский советник, вологодский вице-губернатор А. С. Нарышкин, другие духовные и светские лица, представители известных вологодских фамилий[9]. Адмирал, главный командир Архангельского порта И. Я. Барш погребён в нижнем этаже собора.