Согласно социологическим исследованиям, в 2002 году ислам в Якутии исповедовали 1,9 %, в 2006 — 1,2 % жителей Якутии. Преимущественное распространение получил ислам суннитского толка. Ислам в республике исповедуют большей частью представители народов Северного Кавказа, Закавказья, Поволжья, Средней Азии.
Исторически сложилось, что ислам в Якутии исповедовали, прежде всего, жившие там татары и башкиры. Известно, что к 1913 году в Якутии действовали два мусульманских молитвенных дома и две русско-татарские школы — в Якутске и Олекминске.
Первые мусульманские религиозные организации постперестрочного времени возникли в Якутии в 1994—1996 годах в городах Якутске и Нерюнгри.
В 2005 году в Якутске была открыта одна из самых северных мечетей в России (она севернее, чем Санкт-Петербургская соборная мечеть, но южнее, чем мечеть в Норильске).
Мусульманская община Нерюнгри издаёт небольшим тиражом газету «Ислам в Якутии».