Современное название и административное отношение данного населенного пункта по справочнику:Расположено на левом низменном берегу реки Псел, между селами Горяиново и Нижнее Солотино, по левую сторону дороги, ведущей из Обояни в Белгород, в 6 верстах от уездного города Обояни. Близ села три озера: Ближнее, Рыбное и Белозерное.
Деревня основана в первой половине ХVII века. Названа по фамилии первозаимщиков детей боярских Афанасьевых.
Впервые упоминается в «Росписи Обоянского уезда землям и деревням» воеводы Ивана Микитича Колтовского за 1649 год: «Деревня Офонасьева, в ней 12 дворов».
Упоминается так же в Росписи М.А. Маслова и Ф. Оловянникова 1651 года: «Деревня Афонасьева у реки Псла за крутым верхом, а тот верх с леском. Детей боярских адиннатцать человек дворами построились и живут во дворех. Детей у них и братьев и племянников и внучат тритцать человек. Пашню пашут против своих дворов к Боянскому лесу. Роспахано земли в розных местех шестьдесят десятин с полудесятиною».
В письменных источниках также упоминается под 1681-82 г.г.
Упоминается также в Отказных книгах Обоянского уезда 1687 года в документах по челобитной Обоянкого Знаменского монастыря строителя черного попа Игнатия с братею об отказе монастырю рыбных ловен по реке Пслу и Гнилуше от деревни Афонасьевой до устья речки Трубежа.
В первых ревизских сказках в селении отмечены ее жители, дети боярские, затем превращенные в однодворцев, а ещё позже в государственных крестьян с фамилиями: Афанасьевы, Головины, Звягинцевы, Лабынцовы, Лемяговы, Леонидовы, Переверзевы, Селеховы, Фомины, Чебеневы, Шевелевы и др. Для сведения: все остальные фамилии появились в селе после 3-й ревизии 1748 года).
По статистическим данным 1748 года в деревне насчитывалось 98 жителей мужского пола, все однодворцы.
В деревне не было церкви, и все жители его числились в приходе Николаевского храма села Горяиново.
По статистическим данным 1784 года в деревне было 74 двора, 137 жителей мужского пола, из них 72 двора однодворческих со 127 душами и 2 двора вдовы капитанши Прасковьи Афанасьевны Юшковой, в которых проживало 10 душ крепостных. В пяти верстах от деревни у однодворцев Афанасьевых на колодезе Мокром стояла водяная мельница.
Упоминается в Алфавитах хранящимся в чертежном архиве планам с книгами специального межевания Курской губернии Обоянского уезда как «Афонасова деревня с хуторами Елниковым капитанши Просковьи Афанасьевой дочери Юшкова». Позднее эти земли были размежеваны между несколькими владельцами: статской советницей Варварой Александровной Крыловой, купцом 3-й гильдии Михаилом Андреевичем Асмоловым и вольноотпущенным дворовым человеком Борисом Никитичем Мурашевым.
По сведениям из Ревизских сказок 8-ой ревизии Обоянского уезда 1834 года следует, что земельными наделами в это время в деревне Афанасьева, наряду с однодворцами, владел помещик капитан Глазов Василий Александрович. По сведениям 9-ой ревизии 1850 года и 10-ой ревизии 1858 года - помещица Альхова Мария Филипповна.
По статистическим данным 1862 года в деревне насчитывалось 65 дворов, 225 жителей мужского пола и 256 женского.
По статистическим данным 1892 года в селе числилось 810 жителей, в том числе 412 мужского пола.
В 1913 году в селе Афанасьево земством в честь 300-летия дома Романовых была построена кирпичная школа, которая существует до сих пор. Ныне там размещается школьная столовая и некоторые кабинеты.
В прежние времена деревня была приписана к Рудавскому, затем Зоринскому стану, ещё позже к Павловской волости Обоянского уезда Курской губернии. В настоящее время село является центром муниципального образования «сельское поселение Афанасьевский сельсовет» Обоянского района Курской области. В состав Афанасьевского сельского совета входят: село Афанасьево, деревня Бавыкино, деревня Горяйново, деревня Знобиловка, хутор Запселье, село Камынино, село Нижнее Солотино, хутор Семяновка.