Нагорье - большое старинное торговое село. В начале XVII в. в нём были две церкви: «Преображенье Спасово древяна клецки верх шатровый, стоит без пения», и на р. Меленке погост с церковью Святителя Николая Мирликийского с приделом Великомученицы Ирины (в приделе ни икон, ни книг, ни церковной утвари), строение вотчинника Димитрия Андреевича Замыцкого, который в 1570-1572 гг. был наместником в Мценске.
Когда царь Иоанн Васильевич пошёл в 1572 г. из Александровской слободы против крымского хана на Тулу и на Дедилов, то в передовом полку с Иваном Михайловичем Морозовым был Д.А. Замыцкий, «а люди с ними были по их спискам».
В 1573 г. Дмитрий Андреевич был воеводой в Старице. В 1574 г. под Пернов было послано войско с казанским царём Симеоном Бекбулатовичем, отряд ногайцев находился под начальством Замыцкого. В 1575 г. Замыцкий был одним из голов на Мышеге в правой руке у князя Ивана Юрьевича Голицына; в 1576 г. в Новгороде в большом полку с боярином Иваном Васильевичем Шереметевым, в 1579 г. - наместник и воевода в Ряжске. В1580 г. в Ржеве стояли полки; воеводами передового полка были князь Василий Агишев Тюменский и Замыцкий; на его место был назначен князь Феодор Александрович Масальский, а Замыцкому велено быть в Торопце. В 1581 г. после того, как литовцы выжгли Старую Русу, царь отправил на смену прежним других воевод, в том числе Димитрия Андреевича. Литовцы вторично пришли к Старой Русе и зажгли её, воеводу князя Туренина взяли в плен, потому что остальные воеводы (два Салтыкова и Замыцкий) «побежали, а князя Василья выдали». В 1582 г. Замыцкий описывал земли Деревской пятины (в Новгородской области) и в том же году состоял осадным воеводой в Рузе. В 1583 г., в половине апреля, на Волгу были отправлены войска, в большом полку командовали князь Иван Самсонович Туренин и Замыцкий. Вместе с воеводами передового полка они поставил в Козмодемьянске острог. В 1594 г. Замыцкий делал засеки вместе с Кузьмой Осиповичем Безобразовым. В 1597 г. присутствовал при приёме царём Борисом бургграфа Данавского, нося в это время звание ловчего. Последний раз Д.А. Замыцкий упомянут в документах 1602 г., когда был воеводой в Орешке.
В полуверсте от Преображенской церкви до 1825 г. на погосте, где издавна жили местные священноцерковнослужители, была другая приходская церковь, причисленная позже к Нагорской Преображенской, во имя Святителя и Чудотворца Николая. Предание говорит, что в древности здесь был монастырь, называвшийся «Николо в Тынцах», но следов обители не осталось. По документам XVII в. при церкви Николая Чудотворца «поп Алексий, дьячок Ивашко, пономарь, просвирница, нищие старцы в кельях».
В начале XVII в. село принадлежало окольничему Михаилу Михайловичу Замыцкому, в 1624 г. отписано на государя, но вскоре возвращено прежнему владельцу. В селе тогда было 33 крестьянских двора. Две деревянные церкви существовали до конца XVIII в. Никольская церковь упразднена в 1796 г. после постройки каменного храма, на её месте была поставлена часовня, а поблизости - дома церковнослужителей. Преображенская церковь восстановлена после 1628 г., внесена в окладные книги и обложена данью в 1654 г.
Нагорье принадлежало прежде Екатерине Михайловне Салтыковой вместе с селом Воскресенским (Хмельники), отстоящим от него в 5 верстах, и 16 окрестными деревнями, доставшимися по наследству от нее графу Матвею Федоровичу Апраксину.
В 1770 г. имение это купила императрица Екатерина II и пожаловала в вечное и потомственное владение адмиралу своему Григорию Андреевичу Спиридову за разбитие и истребление им Турецкого флота. Получа имение от щедрот государыни, он начал строить, в знак благодарности, огромную каменную церковь, на месте существовавшей тогда деревянной, во имя Преображения Господня, но, не успев закончить, скончался (похоронен в храме), докончил постройку его старший сын и наследник Нагорья Матвей Григорьевич Спиридов.
В 1770 г. Нагорье перешло в руки знаменитого героя Чесмы, адмирала Григория Андреевича Спиридова. Он родился 18 января 1713 г. в старинной обедневшей дворянской семье, был сыном коменданта Выборга при Петре I Андрея Алексеевича Спиридова и его супруги Анны Васильевны Коротневой. В 1732 г. Спиридов начал службу на флоте. На 16-м году произведён в гардемарины, отправлен в Астрахань, откуда плавал в Персию, затем в Кронштадт, совершил плавание в Любек. В 1732 г. произведён в мичманы, в 1737 г. назначен адъютантом к адмиралу Бредалю. ГА. Спиридов принимал активное участие в Русско-турецкой (1735-1739) и в Семилетней (1756-1763) войнах. В1742 г., уже в чине лейтенанта, плавал в Ледовитый океан. В 1749 г. ему велено присутствовать в Московской Адмиралтейств-конторе.
В 1750 г. назначен командиром императорских яхт и в 1754 г., в чине капитана 3-го ранга, ротным командиром в кадетский корпус. Во время Семилетней войны Спиридов принял участие (в 1760 и 1761 гг.) в экспедиции к берегам Пруссии, командовал десантным отрядом. В1762 г., по производстве в контр-адмиралы, стал командиром действующей эскадры. Вице-адмирал с 1764 г., Спиридов был главным командиром сначала Ревепьского порта, потом Кронштадтского, и начальником «обшивного флота». Екатерина II при посещении этого флота собственноручно возложила на его начальника знаки ордена Святого Александра Невского. Летом 1769 г. Спиридов, по случаю войны с Турцией, был отправлен в Средиземное море и 22 сентября того же года произведён в адмиралы. В начале 1770 г. его эскадра была уже у берегов Морей и вызвала восстание греков против турецкого владычества. Несогласие между Спиридовым и адмиралами Грейгом и Эльфинстоном заставили графа А. Г. Орлова принять на себя главное начальство над флотом, и 26 июня 1770 г. русский флот одержал блистательную победу над Tурецким флотом при Чесме. С особой силой флотоводческий талант Спиридова проявился во время Русско-турецкой войны 1768-1774 гг.
В 1768 г., во время начавшейся войны с Турцией, он был назначен командиром Первой эскадры, а 4 июня 1769 г произведён в полные адмирапы. 18 июля 1769 г. эскадра в составе 7 линейных кораблей, фрегата, бомбардирного судна, 4 транспортов, 2 посыльных судов вышла из Кронштадта и направилась на средиземноморский театр военных действий. 25-26 июня 1770 г. произошло знаменитое Чесменское сражение. Бой начался 23 июня. Русские силы состояли из 9 линейных кораблей, 3 фрегатов и 18 мелких судов, турецкие - из 16 линейных, 6 фрегатов и 60 мелких судов. Русский головной корабль «Европа» потерял управление, и флагманский корабль «Св. Евстафий» с Алексеем Орловым и Спиридовым на борту оказался впереди колонны кораблей. Он сближался с турецким флотом, паля изо всех орудий. Спиридов, с полученным от императрицы образом на груди, с обнажённой шпагой, ходил по мостику, наблюдая за боем. На юте играла музыка. «Евстафий» сцепился с неприятельским адмиральским кораблём, матросы кинулись на абордаж, турецкий корабль запылал. Спиридов и Орлов на катере покинули свой корабль, и вовремя, несколько минут спустя горящая мачта турецкого корабля рухнула на палубу «Евстафия», оба корабля взлетели на воздух. Турецкий флот укрылся в гавани. В ночь с 25 на 26 июня русские начали новую атаку. Спиридов в рупор отдавал приказания, находясь на корабле «Три Иерарха». После короткой перестрелки русскими были пущены зажигательные корабли-брандеры, одному из них удалось зажечь турецкий корабль. Пожар со страшной силой охватил весь турецкий флот, взрывы кораблей следовали один за другим. К утру всё было кончено, русские успели захватить лишь 1 корабль и 6 галер, остальной флот погиб в пламени.
В рапорте адмиралтейской коллегии по случаю разгрома турок при Чесме Г.А. Спиридов писал: «Честь всероссийскому флоту, - неприятельский военный турецкий флот атаковали, разбили, разломали, сожгли, на небо пустили, потопили и в пепел обратили... а сами стали быть во всем архипелаге... господствующими». Впечатление, произведённое Чесменским боем в России, Турции и во всём мире, было громадно. Спиридов занял о. Парос, на котором устроил док для ремонта кораблей, возвёл укрепления. В январе 1771 г. адмирал принял в русское подданство 18 островов. Академия художеств обязана ему многими обломками мраморных античных статуй и барельефов, присланными им с архипелага.
Г.А. Спиридов, по словам современника, соединял великодушие и опытность с храбростью. Но здоровье адмирала было слабо. По его выражению, «последовавшие при старости лет припадки до такого бессилия довели, что совсем одряхлел». Поэтому, когда летом 1772 г. заключено было перемирие и Орлов, давно уже вернувшийся из Петербурга, приехал к флоту, Спиридов с его разрешения оставил свой пост и поехал отдохнуть в Ливорно - «в лучший перед архипелагом климат».
Действительно, в Италии здоровье поправилось «с старостью лет его сходно», и он уже в январе 1773 г. вернулся к флоту - «по усердию и ревности, с великою радостью, для продолжения службы по-прежнему». Впрочем, в письмах его Чернышеву прорываются порою нотки крайней усталости и нерешительности, плохо гармонирующие с этой «великой радостью». Вскоре, за отъездом Орлова, он снова принял главное командование. Весной и летом предпринял ещё одну крупную экспедицию к берегам Сирии и Египта для поддержки вспыхнувшего там восстания. Экспедиция сожгла несколько городов, доков и мелких судов, несколько раз высаживала десанты, и хотя успеха не имела и некоторые высадки стоили довольно крупных потерь (в 1773 г. погиб со всем экипажем один из кораблей эскадры «Азия»), но отвлекла на азиатский берег крупные неприятельские силы. Здоровье Спиридова опять расстроилось, и он подал прошение об отставке, жалуясь на постоянные припадки и головные боли. Орлов, дававший всегда самые лестные отзывы о Спиридове, поддержал его просьбу; в ноябре последовал указ, которым Спиридов увольнялся от службы; за многолетнюю беспорочную службу и исключительные заслуги ему по день смерти было оставлено, в виде пенсии, «полное жалование его чина».
По семейному преданию, Спиридов вышел в отставку, недовольный тем, что главная честь победы при Чесме приписана была Орлову.
За блестящую победу над турками адмирал был награждён высшим орденом Российской империи - Святого Андрея Первозванного - и получил от Екатерины II во владение в Переславском уезде 16 селений (Нагорье, Вехово, Коробово, Маншино, Огорельцево, Сидорково и другие).
В феврале 1774 г. он оставил эскадру и уехал в Россию. Несмотря на дряхлость и болезни, он прожил ещё 17 лет. Спиридов поселился в Москве, лето проводил в Нагорье. В 1785 г. он начал строить в Нагорье, вместо деревянного, обширный каменный храм с тремя престолами: Преображения Господня, Живоначальной Троицы и Рождества Иоанна Предтечи. Вместе с храмом построена колокольня. Скончался ГА. Спиридов в Москве 8 апреля 1790 г. и погребён в с. Нагорье, в церкви, завершённой им в 1787 г. Спиридов и его супруга погребены при входе в трапезную. Спиридов был женат на Анне Матвеевне Нестеровой (род. 1731) и имел 4 сыновей и 2 дочерей: Андрея (1750-1770, адъютант отца), Матвея (1751-1829, сенатор, известный генеалог), Алексея (1753-1828, адмирал, в 8 лет начал плавать на судах с отцом, 9-летним получил чин мичмана за успехи в учёбе и знание морской службы, с 1793 г. вице-адмирал, с 1796 г. получил право на вход во дворец к обеденному столу, с 179д г. командир Ревельского порта, с 1803 г. губернатор Ревеля), Григория (1758-1822, бригадир), Дарью (1761-1805) и Александру (за генерал-лейтенантом Густавом Христиановичем Циммерманом).
Григорий Григорьевич Спиридов, младший из четырёх сыновей адмирала Григория Андреевича, начал службу пажом, долгое время был офицером в Семёновском гвардейском полку, в чине капитана участвовал в Шведской войне при Екатерине II, по окончании этой кампании вышел в отставку в чине бригадира. В 1798 г., при императоре Павле, он был назначен обер-полицмейстером Москвы и занимал эту должность в течение трёх лет, до 1800 г., когда расстроенное здоровье вынудило его уйти на покой. Но наполеоновские войны вновь пробудили в нём воинственный дух, и он, уже сравнительно пожилой человек, в 1812 г. вступил добровольцем в переславское ополчение и в его рядах во время Отечественной войны участвовал в многочисленных стычках. После изгнания французов Спиридов, по указанию его друга графа Ростопчина, был назначен сначала комендантом, затем гражданским губернатором Москвы. В этом качестве он много способствовал восстановлению разрушенного города. С отставкой Ростопчина покинул службу и Спиридов. Он умер 4 мая 1822 г.
Другой сын знаменитого адмирала, Матвей Григорьевич, известный русский генеалог, сенатор, родился 20 ноября 1751 г.; 12-ти лет зачислен в пажи, затем до 1778 г. служил в Семёновском полку, после чего перешёл на гражданскую службу. Пожалованный в камер-юнкеры, он был определён в Сенат за обер-прокурорский стол (отдел), в 1780-х гг. управлял Вотчинной коллегией, в 1793 г. назначен сенатором московских департаментов; 28 октября 1798 г. произведён в действительные тайные советники, в 1800-1802 гг. произвёл сенаторскую ревизию Казанской, Вятской, Оренбургской и Саратовской губерний и 12 декабря 1809 г., состоя по 7-му апелляционному департаменту, уволен от службы. С молодых лет Спиридов занимался литературой и наукой, в 1771 г. участвовал в журнале Рубана «Трудолюбивый муравей». Его научные занятия главным образом были посвящены русской генеалогии. В 1793 и 1794 гг. он издал два тома «Родословного российского словаря» (буквы А и Б), который начал составлять в 1786 г. вместе со своим тестем, историком, князем М.М. Щербатовым, а по смерти последнего в 1790 г. продолжал один. Эти книги в настоящее время являются библиографической редкостью (второй том известен только в одном экземпляре). Составители словаря возвысились до современных научных требований: каждое известие сопровождается точным указанием источника. Перу Спиридова принадлежат ещё «Краткий опыт исторического известия о Российском двойстве», вышедший в свет в 1804 г., и «Сокращённое описание служб огородных российских дворян», первые две части которого вышли в 1810 г.; остальные семь частей, совершенно готовые к печати, сгорели в 1812 г. вместе с московским домом; к счастью, сохранились черновые, которые наследниками были принесены в дар Императорской Публичной библиотеке. Скончался М.Г. Спиридов в 1829 г. С 10 мая 1775 г. он был женат на княжне Ирине Михайловне Щербатовой (1757-1827), с которой имел дочь Акулину и 6 сыновей: Григория (р. 1777), Алексея (род. 1785), Ивана (1787-1821), Александра (р. 1788, в 1843 г. действительный статский советник, начальник Сибирского таможенного округа), Андрея, Михаила (1796-1854).
Всю юго-восточную сторону села занимала при Матвее Григорьевиче Спиридове господская усадьба, пространством в 8 десятин, с прекрасным садом, липовой рощей и оранжереями. По смерти его усадьба эта, вместе с землей и крепостными крестьянами, перешла к детям его и разделена была на 4 части между его сыновьями, из коих две сохранились в прямом роде его и находятся во владении его внуков (теперь осталась одна помещичья усадьба штабс-ротмистра Григория Григорьевича Спиридова). В каждой из усадеб находились владельческие дома и при них сады; в одной из них роща липовая, в другой - березовая.
Сын Матвея Григорьевича, Михаил Матвеевич Спиридов на службу поступил в 1812 г. урядником владимирского ополчения, в 1813-1814 гг. сражался при Люцене, Дрездене, Кульме, в «битве народов» при Лейпциге, участвовал во взятии Парижа, в 1813 г. прапорщик, переведён в лейб-гвардии Гренадерский полк, в 1825 г. был майором Пензенского пехотного полка, член декабристского «Общества соединённых славян», осуждён по 1 - му разряду в каторжную работу вечно (в 1826 г. срок каторги сокращён до 20 лет). В 1827 г. прибыл в Читинский острог в том же году срок сокращён до 15 лет, в 1832 г. - до 13. В 1839 г. вышел на поселение, местом которого по ходатайству братьев был назначен Красноярск. В 15 верстах от города он приобрёл крестьянское хозяйство, куда ему разрешено было переселиться в 1848 г., там он и умер.
По прошению Матвея Григорьевича Спиридова в его усадебном доме в 1821 г была устроена домовая церковь; по его смерти в 1833 г. упразднена.
К храму с. Нагорье были пристроены ещё два придела - Святителя Николая Мирликийского, в память о деревянном храме, и иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость», в 1833 г. устроен ещё придел Казанской иконы Божией Матери (в память о домовом храме). Всех престолов - 6. Причт состоял их двух священников, диакона и псаломщика.
В 1808 г. из богословского отделения Владимирской семинарии ко храму с. Нагорья назначен священник Александр Васильевич Николаевский. В 1835 г. в храм с. Нагорье был назначен священник Василий Ефимович Дроздов, окончивший Владимирскую семинарию в 1834 г. Всю свою жизнь он служил в Нагорьи, был возведен в сан протоиерея. Здесь и похоронен. Михаил Иванович Успенский в 1840 г окончил Владимирскую духовную семинарию, с 1842 г. - диакон с. Нагорья Переславского уезда, с 1871 г. - священник пог. Быкова Суздальского уезда, с 1895 г. вышел за штат, скончался 27 июля 1899 г.
В 1850 г. ко храму с. Нагорье назначен священник Григорий Александрович Елпатьевский. В 1880 г. он напечатал во Владимирских губернских ведомостях (№№ З и 4) статью «Село Нагорье Переславского уезда». Возведен в сан протоиерея. В 1895 г. вышел за штат. Павел Феодорович Приклонский (окончил Владимирскую семинарию в 1852 г.) с 1859 г. - священник в с. Нагорье, в 1885 г. переводится в с. Филипповское Покровского уезда.
В 1876 г. в Спасопреображенском храме с. Нагорье служили священники: Василий Дроздов, Григорий Елпатьевский и Павел Приклонский, диакон Флегонт Чистяков, пономари Феодор Сахаров, Александр Нагорский, Василий Целебров, дьячки Андрей Соколов и Косьма Янов С 1879 г. священником с. Нагорье был Николай Евлампович Розов. Он был переведен в Нагорье из с. Пировы Городища Вязниковского уезда, где служил с 1878 г. Иван Козьмич Янов, после окончания в 1895 г. Владимирской духовной семинарии - псаломщик с. Нагорья Переславского уезда. В 1898 г Владимирскую семинарию окончил Николай Иванович Бессонов. В 1900 г. он был рукоположен со священника к церкви с. Нагорье Переславского уезда.
Церкви принадлежал каменный двухэтажный дом, где помещалось народное училище, и 17 каменных лавок с наружной стороны ограды. По сведениям священника о. Григория Елпатьевского в статье опубликованной им во Владимирских губернских ведомостях за 1880. № 3, 4.: «Нагорский приход, кроме самого села, составляют 15 деревень (государственного ведомства: Фининское, Сидорково, дер. крест, соб. и обязан. Воронкино, Родионово, Михальцово, Меленки, Вехово, Маншино, Огорельцово, Коробово, Овчинники, Камышево, Ананьино, Мясоедово и Торчиново; всего до 1435 душ м.п.) крестьян собственников, временно-обязанных и государственных с населением в 1820 душ м.п. Главное занятие их состоит в земледелии, а по зимам крестьяне, бывшие помещичьими, занимаются ткацкой работой бумажных изделий в 14 светелках, а государственные - бочарной работой. По состоянию народ незажиточный, грамотных мало, народная школа одна, и та частная.
В самом Нагорье дворов крестьянских 114, помещиков, священнослужителей 14, церковный 1, мещанских 13, солдатских, всего же 140 дворов, жителей из крестьян 325 душ м.п., духовных в 3 причтах -26 душ, дворян, купцов, мещан и др. временнопроживающих обывателей до 35 душ, всего 385 д.
Нагорье издавна село торговое, Торговая площадь в центре села принадлежит местным помещикам и др. владельцам. На площади 60 торговых лавок, из них 17 каменных, принадлежат местной церкви; сверх того две линии шатровых лавочных помещений. Торговля производится красным товаром, кожевенным, железным и мучным, мясами, овчинами, лошадь-ми, деревянной и глиняной посудой и др. сельскохозяйственными произведениями; 4 лавки с колониальным товаром. Годовых ярмарок 4: Петровская, Ильинская, Преображенская и Покровская, а еженедельные базары бывают по вторникам с Покрова дня до Петрова дня. В летнюю пору еженедельные базары прекращаются. Торговлю ведут большей частью сторонние торговцы; местные жители в торговые дни занимаются только продажей съестных припасов. Трактиров 3, кабаков 2, постоялых двора 2,1 винный оптовый склад и 1 маслобойное заведение.
В село ведут и в центре его пересекаются 4 дороги - к Переславлю, к Калязину, к Угличу, к Троице-Сергию и Москве. Юго-восточной стороной села протекает ручей свежей, ключевой воды, называемый речкой Меленкой и образующий в начале течения посредством искусственной плотины пруд, весьма пригодный для жителей. В самом селе есть также большие пруды, но вода в них стоячая, потому негодная к употреблению в пищу. Для ежедневного употребления в пищу вода получается из колодцев.
Всей земли у 4 сельских сообществ с. Нагорья с 7 деревнями (Торчиново, Ананкино, Мясоедово, Родионово, Огорельцы, Камышово и Овчинино - все они одного прихода с. Нагорья. Во всем Нагорском обществе по семейным спискам 697 душ м.п. и 765 ж.п.) считается до 2390 десятин, из коих пахотной 813 десятин. Церковной земли -110 десятин. Скот крестьяне содержат только необходимый - лошадей, коров, овец. Излишка продуктов у крестьян не бывает, поэтому в продажу не поступают. Разного рода хлеб, картофель, капуста, огурцы и пр. засеивается в количествах, необходимых каждому землевладельцу. Рыбной ловли в селе нет.
В советское время храм, в котором был похоронен адмирал Спиридов, был разорён. Уже в наше время возвращён верующим и восстанавливается.