Католическая капелла в Шталлупенене была построена в 1927-1928 годах. Капелла представляла собой однонефную базилику с небольшой башней.
В ходе боев Второй мировой войны капелла не была повреждена, в послевоенные годы здание использовалось в качестве кинотеатра, позднее - дома пионеров. В 1993 году капелла была передана Русской православной церкви, 22 июня 1996 года митрополитом Смоленским и Калининградским Кириллом был освящен храм Святого Духа.
Постановлением Правительства Калининградской области от 23 марта 2007 года № 132 капелла получила статус объекта культурного наследия регионального значения.